Das Naturzentrum Amrum gehört dem Öömrang Ferian i.f. an (auf deutsch: Amrumer Verein), dem Heimat- und Naturschutzverein auf Amrum. Mit einer hauptamtlichen Ökologin und einem jährlich wechselndem Freiwilligenteam betreut das Büro des Naturzentrums das Naturschutzgebiet „Amrumer Dünen“, das „Landschaftsschutzgebiet Amrum“ und zusammen mit dem Verein Jordsand und der Schutzstation Wattenmeer einen Teil des Nationalparks Schleswig-Holsteinisches Wattenmeer. Das Naturzentrum zeigt eine Dauerausstellung über Amrums Tierwelt und ihren Lebensraum. Als weiteres Umweltbildungangebot bietet das Team naturkundliche Führungen an, an denen jährlich etwa 10.000 Gäste teilnehmen.